Основное внимание специалисты института уделяют проблемам диагностики, хирургического и комбинированного лечения опухолей головного и спинного мозга, патогенеза, диагностики и лечения травм ЦНС и их последствий, хирургического лечения самых сложных форм сосудистой патологии головного мозга, исследования иммунологических реакций у больных с нейрохирургической патологией ЦНС. Разработанные эффективные методы профилактики и терапии инфекционно-воспалительных осложнений у нейрохирургических больных, внедрено хирургическое и комбинированное лечение эпилепсии, резистентной к стандартным методам лечения. Проводится лечение пороков развития и гидроцефалии у детей, реабилитация нейрохирургических больных. Изучаются механизмы действия стволовых клеток и их влияние на восстановление структур нервной системы. Проводятся нейрохирургические вмешательства при патологии позвоночника и спинного мозга, периферической нервной системы, неукротимых болевых синдромах с использованием современных медицинских технологий.